Journées RENABI-ARENA

Toulouse, 26-28 février

Programme

Mardi 26 février

Après-midi

14h30-14h40 Présentation des journées

C. Gaspin (UBIA & PF Bioinformatique, Toulouse)

14h40-14h50 L’ARN au LRI & la bioinformatique moléculaire à l’IGM

A. Denise (LRI & IGM, Orsay)

14h50-15h40 Le recodage : comment ça marche ? A quoi ça sert ? Quels sont les problèmes qui restent à résoudre ? Et le bioinformatique dans tout ça ?

J.-P. Rousset (IGM, Orsay)

15h40-16h00 Equipes Bordeaux & Lyon

P. Thébaut (PF Génomique, Bordeaux)

16h00-16h30 Pause

16h30-16h40 Equipe bioinformatique de Lille

H. Touzet (LIFL, Lille)

16h40-17h20 Prédiction de structure avec caRNAc : existant et développements en cours

A. Fontaine (LIFL, Lille)

17h20-17h30 Equipe Bioinformatique Toulouse-BIA & PF Bioinformatique

C. Gaspin (BIA & PF Bioinformatique, Toulouse)

17h30-17h50 ApolloRNA

M.-J. Cros (UBIA, Toulouse)

17h50-18h00 Equipe Strasbourg

T. Ludwig (IBMC, Strasbourg)

18h00-18h40 Paradise

T. Ludwig (IBMC, Strasbourg)

18h40-19h00 Présentation du projet BRASERO

A. Denise (LRI & IGM,Orsay)

Mercredi 27 Février

Matin

09h00-09h10 Equipe Bioinformatique Toulouse-LIPM

J. Gouzy (LIPM, Toulouse)

09h10-10h00 LeARN : annotation de gènes d’ARN & application au génome de Meloidogyne incognita

E. Sallet (LIPM, Toulouse)

10h00-10h10 Equipe Symbiose

F. Legeai (INRA/INRIA Symbiose)

10h10-10h40 Stratégie d’identification de micro ARN dans le génome de puceron

F. Legeai (INRA/INRIA Symbiose)

10h40-11h10 Pause

11h10-11h20 Equipe Bioinformatique Evry-IBISC

F. Tahi (IBISC, Evry)

11h20-12h00 Algorithmes pour la prédiction de structure secondaire d'ARN

F. Tahi (IBISC, Evry)

12h00-12h10 Equipe Bioinformatique SIGENAE

P. Bardou (LGC & PF bioinformatique SIGENAE)

12h00-14h30 Déjeuner

Mercredi 27 Février

Après-midi

14h30-14h40 Equipe bioinformatique CGM Gif –sur-Yvette

Y. d’Aubenton (CGM, Gif-sur-Yvette)

14h40-15h30 DARN! : réseaux de contraintes valuées pour la recherche de motifs ARN

T. Schiex (UBIA, Toulouse)

15h30-16h10 Recherche de motifs ARN avec filtrage

H. Touzet (LIFL, Lille)

16h10-16h20 Equipe Bioinformatique au LGC Toulouse

T. Faraut (LGC, Toulouse)

16h20-16h50 Pause

16h50-17h40 Equipe LMGM Toulouse

K. Phok (LMGM, Toulouse)

17h00-17h50 Profils phylogénomiques

D. Gautheret (IGM, Orsay)

17h50-18h00 Equipe MAEM Nancy

Fabrice Leclerc (MAEM,Nancy)

18h00-18h40 La recherche d'ARNnc chez les archaea

Fabrice Leclerc (MAEM,Nancy)

18h40-19h00 Projet RNAspace

C. Gaspin (PF Bioinformatique, Toulouse)

Jeudi 28 février

Matin

09h00-09h50 Complexité moyenne de l’alignement de structures secondaires

C. Herrbach (LRI, Orsay)

09h50-10h40 Pipeline d’annotation par génomique comparative

B. Grenier-Boley (LIFL, Lille)

10h40-11h10 Pause

11h30-12h00 Prédiction de gènes d'ARNnc dans le génome de S. aureus

C. Gaspin (UBIA, Toulouse)