Cours CASM-RPIB
Master (M2) de Bioinformatique et Biostatistiques (BIBS)
Université Paris-Sud 2008-2009
Documents afférents à la séance du jeudi 30 octobre 2008 sur la
modélisation et la génération aléatoire de séquences et structures
génomiques.
Intervenant : Alain Denise (LRI et IGM Orsay).
- Les transparents
du cours.
- L'énoncé du
travail d'application sur machine.
- Quelques références bibliographiques :
- D. Kandel, Y. Matias, R. Unger, P. Winkler. Shuffling biological
sequences Discrete, Applied Mathematics, Volume 71, Number 1, 5
December 1996 , pp. 171-185(15). Voici une version préliminaire de
l'article.
- Y. Ponty, M. Termier, A. Denise. GenRGenS:
Software for generating random genomic sequences and structures,
Bioinformatics, June 2006 22(12):1534-1535.
- Y. Ponty.
Modélisation de séquences génomiques structurées, génération aléatoire
et application, Thèse de l'Université Paris-Sud 11, 2006.
- A. Denise, O. Roques and M. Termier. Génération aléatoire de séquences
génomiques structurées. Manuscrit, décembre 2001.