Je suis actuellement en quatrième année de thèse. Mon sujet porte sur l'analyse des génomes et en particulier l'étude des mécanismes de traduction non conventionnels.

La traduction est le mécanisme qui permet de synthétiser les protéines à partir d'ARN (acide ribonucléique). L'ARN est un code écrit sur 4 bases : l'adénosine, la cytosine, la guanine et l'uracile. Elles sont très souvent abrégées en A, C, G et U. La lecture de ce code s'effectue séquentiellement, 3 bases par 3. Parmi les 64 triplets, un code le début de la traduction et trois codent sa fin. J'étudie les exceptions à ces règles. Le ribosome, qui fait office de tête de lecture, peut en effet effectuer certains mouvements théoriquement interdits :
    - le décalage du cadre de lecture ;
    - la translecture ;
    - le saut de ribosome.

J'effectue ma thèse au Laboratoire de Recherche en Informatique de l'Université d'Orsay sous la direction de Christine Froidevaux et d'Alain Denise .

Nous avons la chance de travailler avec deux équipes de l' Institut de Génétique et de Microbiologie : celle de Jean-Pierre Rousset ( Génétique moléculaire de la traduction ) et celle de Michel Termier ( Bioinformatique des Génomes ).

Les scientifiques d'Orsay intéressés par la biologie (mathématiciens, physiciens, informaticiens, chimistes et, bien sûr, biologistes) sont associés dans le groupe langage du génome .
 
 
 

Les séminaires et colloques auxquels j'ai assisté
 

Analyse in silico de séquences génomiques , 17-28 juillet 2000, Marseille

Séminaire algorithmique et biologie , 13-15 septembre 2000, Institut Pasteur, Paris

Colloque traitement et analyse de séquences , 22-24 novembre 2000, Evry

Réunion REMAG (recherche et extraction de motifs pour l'analyse des génomes), 16 janvier 2001,  Institut Pasteur, Paris

Séminaire de l' équipe GRAPPA , 17 mai 2001, Lille

JOBIM, 30 mai-1^er juin 2001, Toulouse : j'y ai présenté un exposé intitulé "Vers une modélisation des sites de décalage de cadre en -1"

Repliement et auto-assemblage des macromolécules , 27 novembre-1^er décembre 2001, Bures-sur-Yvette

RECOMB , 18-21 avril 2002, Washington D.C.

JOBIM , 10-12 juin 2002, Saint-Malo

Structures secondaires d'ARN , 24-26 juin 2002, Dijon

Enseignement 2000-2001

    J'ai enseigné :
    - en 1ere annnée de DEUG : la programmation fonctionnelle et le langage CAML à 2 groupes de TP.
    - en 2eme année de DEUG : le module "Mathématiques pour l'informatique" à 1 groupe de TP et le module "Langage et génie logiciel" à 1 groupe de TP.
    - en licence d'informatique : la programmation logique et Prolog à 1 groupe de TD/TP.
 
 

Enseignement 2001-2002

    J'ai enseigné :
    - en 1ère annnée de DEUG : la programmation impérative et le langage Pascal à 1 groupe de TP.
    - en 2ème année de DEUG : le module "Mathématiques pour l'informatique" à 2 groupes de TP.
    - en licence d'informatique : l'algorithmique et le langage C à un groupe de TER (TD/TP).
 

Enseignement 2002-2003
    J'ai enseigné :
    - en 2ème annnée de DEUG : le module "Mathématiques pour l'informatique" à 1 groupe de TD.
    - en licence de bio-informatique : l'algorithmique et le langage C à un groupe de TD/TP.

Enseignement 2003-2004
    J'enseigne :
    - en licence de bio-informatique : l'algorithmique et le langage C à un groupe de TD/TP.
    - en 2ème annnée de DEUG : le module "Mathématiques pour l'informatique" à 1 groupe de TD.
    - en licence d'informatique : le module "Langages formels" à 1 groupe de TD.