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  Le fichier de configuration pour cette simulation est le suivant:

 

title = "Actin strands polymerisation"; geometry = 80:80; molecule P (200, 0, 0), // actine filamenteuse 'plus'. M (0, 200, 0), // actine filamenteuse 'moins'. AF (200, 200, 0, inactive), // actine filamenteuse inerte. ADP_AG (0, 100, 200), // dephosphorylated globular actin. ATP_AG (200, 100, 0); // phosphorylated globular actin. speed (AF) = 0.0; speed (P) = 0.0; speed (M) = 0.0; maxlinks (P) = AF(1), M(1); maxlinks (M) = AF(1), P(1); maxlinks (AF) = AF(2), M(1), P(1); // formation des dimères. {~ATP_AG}ATP_AG + {~ATP_AG}ATP_AG -> M * P [0.05]; M * P -> ADP_AG + ADP_AG [0.5]; // formation des polymères par le bout plus. ATP_AG + P -> P = AF [0.8]; P * AF -> ADP_AG + P [0.001]; // formation des polymères par le bout moins. ATP_AG + M -> M = AF [0.3]; M * AF -> ADP_AG + M [0.005]; // 0.06 -> treadmilling. // rephosphorylation. ADP_AG -> ATP_AG [0.0005]; /* * Initialisation de l'espace. */ init (2000, ATP_AG);