Laboratoire de Recherche en Informatique -
Equipe Bioinformatique
Bastien Rance
| E-mail | rance (at) lri (.) fr |
| Page personnelle | http://www.lri.fr/~rance/ |
| Postion | Doctorant |
| Téléphone | 01.69.15.42.35 |
| Fax | 01.69.15.65.86 |
| Bureau | 148 |
| Adresse | LRI, Bât 490, Centre Scientifique, F-91405 ORSAY CEDEX FRANCE |
| Equipe | bioinformatique |
Thèse
Sous la direction de
Christine FroidevauxTitre : Fouille et Intégration de Données Biologiques Hétérogènes
Publications
| [5] | An adaptive combination of matchers: application to the mapping of biological ontologies for genome annotation (Bastien Rance, Jean-Francois Gibrat, Christine Froidevaux) In Data Integration in the Life Sciences DILS 2009, 2009. [bib] |
| [4] | Discovering relevant sequential associations between heterogeneous features of proteins (Bastien Rance, Frédérique Lisacek, Christine Froidevaux) In Data Integration in the Life Sciences DILS 2007, 2007. [bib] |
| [3] | An Algorithm for Mining Minimal Sequential Nuggets of Knowledge (Bastien Rance, Frédérique Lisacek, Christine Froidevaux), 2007. [bib] |
| [2] | Extracting Sequential Nuggets of Knowledge (Christine Froidevaux, Frédérique Lisacek, Bastien Rance) In International Conference on Database and Expert Systems Applications DEXA'07, 2007. [bib] |
| [1] | Using Protein Motif Combinations to Update KEGG (Frédéric Nikitin, Bastien Rance, Masumi Itoh, Minoru Kanehisa, Frédérique Lisacek) In Genome Informatics, 2004. [bib] |
Logiciels
SNK et SNK-DeeVee a été conçu en collaboration avec Frédérique Lisacek (Swiss Institute of Bioinformatics, Genève).
2008:
un algorithme de recherche de pépites séquentielles de connaissance et deux extensions de ce concept. SNK-DeeVee permet aussi de visualiser les pépites séquentielles de connaissance trouvées sur un ensemble d'architectures protéines2007:
SNK : un algorithme de recherche de pépites séquentielles de connaissanceEnseignement
96 heures équivalent TD
2008-2009
- Java (49h) : TD/TP 2e année
- ACSI -UML- (48h) : Cours intégrés, TP, TP. Apprentis 2e année.
3x64 heures équivalent TD
public : étudiants de 2e année
2007-2008
- Java (49h) : TD/TP
- Projet de programmation (22,5h) : Java -Swing, Graphics2D, Java Sound API-, tests JUnit, XML, SVN. Projet de groupe pour 14 étudiants
2006-2007
- Java (21h) : TD/TP
- Option Java (15h) : TP. Apprentis 2e année
- Projet de programmation (22,5h) : projet commun pour un groupe de 14 étudiants
2005-2006
- ACSI -UML- (24h): TD
- Projet de programmation (22,5h) : projet commun pour un groupe de 14 étudiants
- Projets tuteurés (2x8h) : 1er année, 2 groupes de 4 étudiants
Liens


