M. DENISE Alain

Professeur classe exceptionnelle Université Paris-Saclay Bioinformatique Tel : (+33 1691)56369 Fax : (+33 1691)56586 Bureau : 167/PCRI-S Page personnelle : http://www.lri.fr/~denise/ Courrier électronique : Alain.Denise@lri.fr Activités de recherche    - Combinatoire    - Biologie des systèmes    - Biologie structurale Publications Responsabilités administratives    - Membre du conseil de laboratoire    - Responsable d'équipe    - Membre de la CCSU    - Membre du conseil scientifique    - Directeur de l'Ecole Doctorale STIC de Paris-Saclay Résultats majeurs    - Average complexity of the Jiang-Wang-Zhang pairwise tree alignment algorithm and of a RNA secondary structure alignment algorithm    - Le logiciel VARNA à l'honneur    - Automated prediction of three-way junction topological families in RNA secondary structures    - Tree decomposition and parameterized algorithms for RNA structure-sequence alignment including tertiary interactions and pseudoknots    - A new dichotomic algorithm for the uniform random generation of words in regular languages Logiciels et brevets    - GenRGenS : Generation of Random Genomic Sequences and Structures    - VARNA : Visualisation Applet for RNA    - NestedAlign : Pairwise RNA secondary structure comparison    - Rna3Dmotif : Software for extracting RNA tertiary motifs    - Cartaj : Classification Of RNA threeway Junctions    - ConQuR-Bio : ConQuR-Bio    - LiCoRNA : aLignment of Complex RNAs    - GARN : Game Algorithms for RNa 3D sampling    - CaRNAval : Database of RNA Recurrent Interaction Networks    - Orphea : Pseudo-knot RNA sequence finder Thèses et habilitations Habilitation à diriger des recherches   - Structures aléatoires, modèles et analyse des génomes