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Production scientifique
Résultat majeur : THE AVERAGE COMPLEXITY OF TREE ALIGNMENT
THE AVERAGE COMPLEXITY OF TREE ALIGNMENT
28 janvier 2008

Nous avons démontré que la complexité moyenne de l'algorithme d'alignement d'arbres de Jiang, Wang et Zhang (1995) est en O(n^2).
Le fait étonnant est que la complexité moyenne de l'alignement d'arbres est du même ordre que celle de l'alignement de séquences ! Ce résultat se généralise au calcul de la complexité de l'alignement de structures secondaires d'ARN.

Référence :

Claire Herrbach , Alain Denise , Serge Dulucq, Average complexity of the Jiang-Wang-Zhang pairwise tree alignment algorithm and of a RNA secondary structure alignment algorithm, Proceedings of MACIS 2007.



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