Français Anglais
Accueil Annuaire Plan du site
Accueil > Production scientifique > Résultat majeur
Production scientifique
Résultat majeur : THE AVERAGE COMPLEXITY OF TREE ALIGNMENT
THE AVERAGE COMPLEXITY OF TREE ALIGNMENT
28 janvier 2008

Nous avons démontré que la complexité moyenne de l'algorithme d'alignement d'arbres de Jiang, Wang et Zhang (1995) est en O(n^2).
Le fait étonnant est que la complexité moyenne de l'alignement d'arbres est du même ordre que celle de l'alignement de séquences ! Ce résultat se généralise au calcul de la complexité de l'alignement de structures secondaires d'ARN.

Référence :

Claire Herrbach , Alain Denise , Serge Dulucq, Average complexity of the Jiang-Wang-Zhang pairwise tree alignment algorithm and of a RNA secondary structure alignment algorithm, Proceedings of MACIS 2007.



Activités de recherche
  ° Algorithmique
  ° Bioinformatique
  ° Combinatoire

Equipe
  ° Bioinformatique

Contact
  [aucun]
Résultats majeurs
BEST PAPER AWARD: SELF-STABILIZING DISTRIBUTED STABLE MARRIAGE
05 novembre 2017
SSS 2017, M. Laveau, G. Manoussakis, J. Beauquier, T. Bernard, J. Burman, J. Cohen, and L. Pilard

INFORMATION-GEOMETRIC OPTIMIZATION ALGORITHMS: A UNIFYING PICTURE VIA INVARIANCE PRINCIPLES
02 mai 2017
Yann Ollivier, Ludovic Arnold, Anne Auger, Nikolaus Hansen - JMLR 18(18):1−65, 2017.

FORMAL MUTATION TESTING FOR CIRCUS
21 avril 2016
Alex Donizeti Betez Alberto, Ana Cavalcanti, Marie-Claude Gaudel, Adenilso Simao Journal of Infor

CELL-CELL COMMUNICATION ENHANCES THE CAPACITY OF CELL ENSEMBLES TO SENSE SHALLOW GRADIENTS DURING MORPHOGENESIS
09 février 2016
D. Ellison, A. Mugler, M.D. Brennan, S.H. Lee, R.J. Huebner, E.R. Shamir, L.A. Woo, J. Kim, P. Amar,

COMPUTING WITH SYNTHETIC PROTOCELLS
13 mai 2015
Alexis Courbet, Franck Molina and Patrick Amar