Doctorat
Equipe : Bioinformatique
Analyse des voies métabolique au cours du cycle cellulaire : application au métabolisme du cancer
Début le 01/10/2016
Direction : PERES, Sabine
Ecole doctorale : ED STIC 580
Etablissement d'inscription : Université Paris-Saclay
Lieu de déroulement : LRI - BioInfo
Soutenue le 05/11/2020 devant le jury composé de :
- Jean-Paul Comet, Professeur, Université de Nice Sophia Antipolis, Rapporteur et Examinateur
- Jean-Marc Schwartz, Professeur associé, University of Manchester, Rapporteur et Examinateur
- François Fages, Directeur de recherche, INRIA - Saclay, Examinateur
- Matthieu Jules, Professeur, INRAE Jouy-en-Josas (Micalis), Examinateur
- Pascale Le Gall, Professeure, CentraleSupelec, Examinatrice
- Laurent Schwartz, Docteur, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
- Sabine Peres, Maître de conférence, HDR, Université Paris-Saclay, Directrice de thèse
- Laurent Tournier, Chargé de recherche, INRAE Jouy-en-Josas (MaIAGE), Co-encadrant de thèse
Activités de recherche :
Résumé :
L’objectif de cette thèse est d’étudier comment la cellule mammifère adapte son métabolisme aux étapes du cycle cellulaire. Le cycle cellulaire est l’ensemble des étapes menant une cellule à se diviser. Le rôle du métabolisme est de fournir à la cellule les éléments et l’énergie dont elle a besoin pour fonctionner. En particulier, à chaque étape du cycle cellulaire, la cellule a besoin de différents éléments pour pouvoir, à terme, se diviser correctement. Il est donc crucial pour la cellule de coordonner le métabolisme et le cycle cellulaire et en particulier de contrôler ce que le métabolisme produit au cours du cycle cellulaire.
Pour mieux comprendre ce lien entre ces deux processus, nous avons étudié comment un modèle mathématique du métabolisme répondait à différentes variations imposées par le cycle cellulaire et nous avons comparé ces réponses à la littérature. Satisfaits des résultats obtenus, nous avons alors construit un modèle hybride représentant l’évolution du métabolisme au cours du cycle cellulaire. Nous retrouvons dans ce modèle hybride les grandes variations connues des voies métaboliques au cours des phases du cycle cellulaire ainsi que des variations expérimentales des métabolites énergétiques et redox.
Encouragés par ces résultats, nous avons finalement perturbé notre modèle hybride pour retrouver des tendances du métabolisme dues au cancer, un ensemble de maladies touchant à la fois le cycle cellulaire et le métabolisme.
