>Christine Froidevaux (LRI Orsay, Équipe Bioinformatique)
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Équipe Bioinfo



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Laboratoire de Recherche en Informatique - Équipe Bioinformatique
Christine Froidevaux

Identité
E-mail [chris] @ [lri.fr]
Page personnelle http://www.lri.fr/~chris
Position Professeur Université Paris-Sud (UFR des Sciences)
Téléphone (33) 1 69 15 65 07
Fax (33) 1 69 15 65 86
Bureau 172
AdresseLRI - CNRS UMR 8623
Bât Ada Lovelace - Université Paris-Sud
F-91405 Orsay Cedex


Présentation générale

Professeur d'informatique à l'Université Paris-Sud (27ème section), je suis membre de l'équipe Bioinformatique du LRI.

Responsable du Master mention Bioinformatique de l'Université Paris-Saclay, je suis plus particulièrement responsable du parcours Biologie Computationnelle : Analyse, Modélisation et Ingénierie de l'Information Biologique et Médicale M2 AMI2B de Paris-Sud.

Vice-Présidente enseignement de la Société Informatique de France SIF.


Le congrès SIF 2019 aura lieu à Bordeaux les 6 et 7 février.



Recherche Publications Enseignement Médiation scientifique

Recherche

THÈMES

  • Bioinformatique des génomes
    • Intégration et extraction de connaissances dans des sources de données biomédicales
    • Biologie des systèmes : construction et analyse de réseaux biologiques

  • Méthodes informatiques
    • Intégration et interrogation de sources de données ; conception et mapping d'ontologies
    • Analyse de workflows scientifiques
    • Représentation et analyse de données ; raisonnement sur des connaissances expertes


PROJET

ANR ABLISS : Automating Building from Literature of Signalling Systems


ENCADREMENT DE THESES
  • Une approche logique de l'identification systématique de modèles informatiques de réseaux dédiés à la prédiction des interactions génétiques en synergie pour la prolifération tumorale (Stéphanie Chevalier, co-encadrement Loic Paulevé, LRI, et Andrei Zinovyev, Institut Curie)
  • Reconstruction de réseaux métaboliques par annotation fonctionnelle et complétion de ces réseaux par intégration de données hétérogènes (Alexandra Zaharia, co-encadrement avec Alain Denise, LRI ; thèse soutenue en septembre 2018)
  • Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse de réseaux moléculaires SBGN (Adrien Rougny, en collaboration avec Anne Poupon, INRA BIOS ; thèse soutenue en octobre 2016)
  • Intégration de données et workflows scientifiques (Jiuqiang Chen, co-encadrement avec Sarah Cohen-Boulakia, LRI ; thèse soutenue en octobre 2013)

BIBLIOGRAPHIE

Liste de publications.

Enseignement

J'enseigne dans la licence d'informatique de l'Université Paris-Sud et dans le Master de Bioinformatique de l'université Paris-Saclay, parcours M1 BIBS et M2 AMI2B.

Médiation scientifique et société

  • Société Informatique de France
    VP de la SIF, je contribue à ses actions de promotion de l'informatique en tant que discipline, de la maternelle au supérieur. Je suis également membre du comité éditorial de son Bulletin 1024.
    Retrouvez aussi l'actualité de l'informatique sur Binaire, le blog du Monde sur l'informatique.

  • Temps d'activité périscolaire en Primaire (TAP)
    Dans le cadre d'une activité de formation du labex Digicosme, j'ai animé une séance hebdomadaire d'informatique en école primaire (CE2, CM1, CM2) sur le temps périscolaire pendant deux ans.

  • Ethique
    Je suis membre de la Commission de réflexion sur l'Ethique de la Recherche en sciences et technologies du Numérique d'Allistène CERNA,