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Membre du CA de la Société Informatique de France SIF.
Membre du Comité National Pilote d'éthique du Numérique CNPEN.
Membre du Comité d'éthique pour les données d'éducation.
| Recherche | Publications | Enseignement | Médiation scientifique et société |
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- Bioinformatique des génomes
- Intégration et extraction de connaissances dans des sources de données
biomédicales
- Biologie des systèmes : construction et analyse de réseaux biologiques
- Intégration et extraction de connaissances dans des sources de données
biomédicales
- Méthodes informatiques
- Intégration et interrogation de sources de données ; conception et mapping d'ontologies
- Analyse de workflows scientifiques
- Représentation et analyse de données ; raisonnement sur des connaissances expertes
PROJET
ANR ABLISS : Automating Building from Literature of Signalling Systems
ENCADREMENT DE THESES
- Science des données pour les réseaux de signalisation biologique (Aziza Filali Rotbi, thèse dans le cadre du projet ABLISS co-encadrée par Nicole Bidoit et Philippe Chatalic, LRI)
- Une approche logique de l'identification systématique de modèles informatiques de réseaux dédiés à la prédiction des interactions génétiques en synergie pour la prolifération tumorale (Stéphanie Chevalier, co-encadrement Loic Paulevé, LRI, et Andrei Zinovyev, Institut Curie)
- Reconstruction de réseaux métaboliques par annotation fonctionnelle et complétion de ces réseaux par intégration de données hétérogènes (Alexandra Zaharia, co-encadrement avec Alain Denise, LRI ; thèse soutenue en septembre 2018)
- Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse de réseaux moléculaires SBGN
(Adrien Rougny, en collaboration avec Anne Poupon, INRA BIOS ; thèse soutenue en octobre 2016)
- Intégration de données et workflows scientifiques (Jiuqiang Chen, co-encadrement avec Sarah Cohen-Boulakia, LRI ; thèse soutenue en octobre 2013)
BIBLIOGRAPHIE
Liste de publications.
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- Filière de Bioinformatique
- Master M1 BIBS
- Bases de Données
- Algorithmique et Complexité
- Fouille de données
- Master M2 AMI2B
- Intégration de données et Big Data
- Formation à la Recherche
- Master M1 BIBS
- Filière d'informatique
- Licence L1 - S2
- Programmation impérative
- Licence L1 - S2
- Livre d'enseignement
"Types de données et algorithmes", Christine Froidevaux, Marie-Claude Gaudel et Michèle Soria, McGraw-Hill, Collection Informatique,1994, 575 pages.
Le livre (édition 1990)
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- Société Informatique de France
J'ai été vice-présidente de la SIF de 2015 à 2020. J'ai contribué à ses actions de promotion de l'informatique en tant que discipline, de la primaire au supérieur. J'ai été également membre du comité éditorial de son Bulletin 1024.
Retrouvez aussi l'actualité de l'informatique sur Binaire, le blog du Monde sur l'informatique.
- Temps d'activité périscolaire en Primaire (TAP)
Dans le cadre d'une activité de formation du labex Digicosme, j'ai animé une séance hebdomadaire d'informatique en école primaire (CE2, CM1, CM2) sur le temps périscolaire pendant deux ans.
- Ethique
J'ai été membre de la Commission de réflexion sur l'Ethique de la Recherche en sciences et technologies du Numérique d'Allistène CERNA, de 2016 à 2019.
Je suis membre du Comité National Pilote d'Ethique du Numérique CNPEN et membre du Comité d'éthique pour les données d'éducation du ministère de l'Education Nationale, de la Jeunesse et des Sports, depuis fin 2019.